Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms