Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FCGRTP55899 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms