Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP5P45974 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP5P45974 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP5P45974 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP5P45974 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms