Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPARGP37231 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms