Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms