Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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