Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP4AP20648 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms