Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHCEP18577 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHCEP18577 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHCEP18577 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHCEP18577 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHCEP18577 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHCEP18577 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHCEP18577 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHCEP18577 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms