Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCF2P10911 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCF2P10911 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCF2P10911 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCF2P10911 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms