Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC172P0C7W6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms