Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC159P0C7I6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC159P0C7I6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms