Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLSTN1O94985 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLSTN1O94985 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms