Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN15O75808 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms