Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP1O15259 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHP1O15259 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms