Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB6O15197 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms