Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASKO14936 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASKO14936 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASKO14936 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms