Protein–RNA interactions for Protein: O00198

HRK, Activator of apoptosis harakiri, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRKO00198 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HRKO00198 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HRKO00198 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HRKO00198 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HRKO00198 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HRKO00198 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms