Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KR12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3KR12 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KR12 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KR12 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms