Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L13C9JLJ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms