Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP18Q9UMW8 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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USP18Q9UMW8 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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