Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
BPTFQ12830 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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