Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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