Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms