Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SEMA3CQ99985 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SEMA3CQ99985 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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