Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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