Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms