Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN4AP35499 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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