Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD13P35453 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms