Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
EHD3Q9NZN3 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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