Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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