Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 MIR5003-201ENST00000581891 99 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 CYP2B7P-203ENST00000599198 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 ELP2-205ENST00000442325 2722 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 GMPR2-203ENST00000399440 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 USP17L21-202ENST00000621388 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 GUCY1B3-201ENST00000264424 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 IKZF5-205ENST00000617859 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 CPVL-203ENST00000409850 2213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 BRINP1-201ENST00000265922 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL356599.1-205ENST00000606388 3961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 ANK2-216ENST00000510275 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 ACOT9-204ENST00000379303 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 CYP2G1P-201ENST00000252909 2511 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 MST1L-202ENST00000455405 3184 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 SLC16A7-214ENST00000552024 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZFAT-AS1-201ENST00000505776 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 GRIA1-213ENST00000521843 3069 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 DDX3P3-201ENST00000506389 1994 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL391988.1-201ENST00000614747 1553 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 SEC16A-204ENST00000313084 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRHP20396 MAPK10-210ENST00000449047 2382 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 GRM8-203ENST00000358373 3850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC00494-201ENST00000416742 3544 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 MAK-201ENST00000313243 3984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 TUBB1-201ENST00000217133 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC139495.3-201ENST00000515156 4437 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 ELP4-210ENST00000638482 3084 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms