Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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