Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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