Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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USP39Q53GS9 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP39Q53GS9 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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