Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL687P-201ENST00000480496 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC011472.3-201ENST00000586051 906 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC080112.3-201ENST00000612552 880 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms