Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FAM3AP98173 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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