Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms