Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TNNT3P45378 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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