Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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