Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms