Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms