Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NBNO60934 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NBNO60934 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NBNO60934 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms