Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL117338.1-201ENST00000434552 631 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC239367.1-201ENST00000439389 936 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC010099.2-201ENST00000443177 373 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 DAZAP2P1-201ENST00000475212 503 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC104164.4-201ENST00000483456 493 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC006206.2-201ENST00000537192 992 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC013457.1-201ENST00000556770 1011 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02134-201ENST00000562980 557 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC007614.1-201ENST00000566607 309 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL590705.1-201ENST00000607322 484 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC104237.3-201ENST00000611809 427 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4A11-204ENST00000462347 1775 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 485.6 ms