Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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CCDC96Q2M329 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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CCDC96Q2M329 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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CCDC96Q2M329 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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CCDC96Q2M329 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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