Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms