Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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