Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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