Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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HOXD13P35453 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD13P35453 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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