Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PSMB4P28070 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PSMB4P28070 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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