Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PRKCHP24723 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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